药学院药学一级学科硕士学位授予权于2010年获得批准，下设六个二级学科：药物分析学、药剂学、生药学、微生物与生化制药、药物化学、药理学。自主设置“藏药学”和“药用植物资源”二级学科硕士学位授予权于2011年获得批准。
（1）药物分析学（pharmaceutical analysis）
学科门类：医学 代码：100704
一级学科：药学 代码：1007
研究方向：1．药物色谱分析；2．药物质量控制技术研究；3．体内药物分析。
培养目标：本专业培养德、智、体、美全面发展的,适应社会主义现代化建设需要和具有较强实践能力，能在药品生产、检验、及研究开发领域从事药物分析及相近专业的高层次、应用型专门人才。
专业要求：掌握本学科坚实的基础理论、专门知识、现代实验方法和技能；熟悉所从事研究方向的发展趋势；具有进行科研及独立担负专门技术工作的能力；能应用一种外语较熟练地阅读与专业有关的文献资料，并能用外文撰写论文。
学习年限：一般为3年。
课程设置：公共必修课，有机波谱分析、天然药物化学、现代仪器分析原理、体内药物分、计算药物分、药物色谱分析、药物电化学分析、医学统计学、药学文献检、生物药剂学与药物动力学、药学文献检索、药学实验、现代药学讲座等。
毕业要求：总学分≥37学分。学位课程8门，学位课程成绩≥70分获得相应学分，其它课程成绩60分获得学分。其中专业选修课不少于8学分，教学实践或社会实践不少于3学分。在规定修业年限内修满规定学分，通过思想品德考核，学位论文答辩，符合《中华人民共和国学位条例》有关规定，达到我校学位授予标准，授予医学硕士学位。
（2）药剂学（pharmacy）
学科门类：医学，代码：100702
所属一级学科：药学，代码：1007
研究方向：1、中藏药新药研发；2、药物新剂型开发
培养目标：本专业培养德、智、体、美全面发展的,适应社会主义现代化建设需要和具有较强实践能力，能在药品生产、检验、及研究开发领域从事专业工作的高层次、应用型专门人才。
专业要求：系统掌握本学科的理论知识及本学科的实验方法和技能；熟悉所从事研究方向的发展趋势；具有独立进行科学研究工作的能力；能应用一种外语较熟练地阅读与专业有关的文献资料，并能用外文撰写论文。
学习年限：一般为3年。
课程设置：公共必修课，药物色谱分析、工业药剂学、药理学、微生物药物学、生物药剂学与药物动力学、物理药剂学、现代仪器分析原理、医学统计学、药学文献检索、药用高分子材料、药品生产质量管理规范（gmp）、新药研究方法与技术、药物制剂设备、药学实验、现代药学讲座等。
毕业要求：总学分≥37学分。学位课程8门，学位课程成绩≥70分获得相应学分，其它课程成绩60分获得学分。其中专业选修课不少于8学分，教学实践或社会实践不少于3学分。在规定修业年限内修满规定学分，通过思想品德考核，学位论文答辩，符合《中华人民共和国学位条例》有关规定，达到我校学位授予标准，授予医学硕士学位。
（3）生药学（pharmacognosy）
学科门类：医学，代码：100703
所属一级学科：药学，代码：1007
研究方向：1．生药质量控制及品质评价；2．生药资源与开发利用；3．生药质量标准化。
培养目标：本专业培养德、智、体、美全面发展的,适应社会主义现代化建设需要和具有较强实践能力，能在药品生产、检验、及研究开发领域从事专业工作的高层次、应用型专门人才。
专业要求：系统掌握本学科的理论知识及本学科的实验方法和技能；熟悉所从事研究方向的发展趋势；具有独立进行科学研究工作的能力；能应用一种外语较熟练地阅读与专业有关的文献资料，并能用外文撰写论文。
学习年限：一般为3年。
课程设置：现代生药学概论、药用植物学、天然药物化学、药物色谱分析、分子生物学、有机波谱分析、现代仪器分析原理、、医学统计学、药学文献检索、中药学、生药实验技术、现代药学讲座等。
毕业要求：总学分≥37学分。学位课程8门，学位课程成绩≥70分获得相应学分，其它课程成绩60分获得学分。其中专业选修课不少于8学分，教学实践或社会实践不少于3学分。在规定修业年限内修满规定学分，通过思想品德考核，学位论文答辩，符合《中华人民共和国学位条例》有关规定，达到我校学位授予标准，授予医学硕士学位。
（4）微生物与生化药学（microbial and biochemical pharmacy）
学科门类：医学，代码：100705
所属一级学科：药学，代码：1007
研究方向：1、生物技术与生物制药；2、微生物药物研究开发；3、药源微生物菌种选育与发酵工艺
培养目标：本专业培养德、智、体、美全面发展的,适应社会主义现代化建设需要和具有较强实践能力，能在生物技术与生物制药开发领域从事专业工作的高层次、应用型专门人才。
专业要求：系统掌握本学科的理论知识及本学科的实验方法和技能；熟悉所从事研究方向的发展趋势；具有独立进行科学研究工作的能力；能应用一种外语较熟练地阅读与专业有关的文献资料，并能用外文撰写论文。
学习年限：一般为3年。
课程设置：微生物药物学、分子生物学、药物色谱分析、发酵工程、生化分离工程、生物制药、现代仪器分析原理、免疫学基础、微生物实验方法与技术、医学统计学、药学文献检索、有机波谱分析、生物技术新方法进展、现代药学讲座等。
毕业要求：总学分≥37学分。学位课程8门，学位课程成绩≥70分获得相应学分，其它课程成绩60分获得学分。其中专业选修课不少于8学分，教学实践或社会实践不少于3学分。在规定修业年限内修满规定学分，通过思想品德考核，学位论文答辩，符合《中华人民共和国学位条例》有关规定，达到我校学位授予标准，授予医学硕士学位。
（5）药理学（pharmacology）
学科门类：医学，代码：100706
所属一级学科：药学，代码：1007
研究方向：1、天然药物药理研究；2、体内药物分析、药物与临床合理用药。
培养目标：本专业培养德、智、体、美全面发展的,适应社会主义现代化建设需要和具有较强实践能力，能在药品生产、检验及研究开发领域从事专业工作的高层次、应用型专门人才。
专业要求：系统掌握本学科的理论知识及本学科的实验方法和技能；熟悉所从事研究方向的发展趋势；具有独立进行科学研究工作的能力；能应用一种外语较熟练地阅读与专业有关的文献资料，并能用外文撰写论文。
学习年限：一般为3年。
课程设置：生理学、药理学、毒理学、中药药理学、临床药理学、生物药剂学与药物动力学、微生物药物学、医学统计学、药物色谱分析、体内药物分析、药学文献检索、药理实验方法学、药理学进展、现代药学讲座等。
毕业要求：总学分≥37学分。学位课程8门，学位课程成绩≥70分获得相应学分，其它课程成绩60分获得学分。其中专业选修课不少于8学分，教学实践或社会实践不少于3学分。在规定修业年限内修满规定学分，通过思想品德考核，学位论文答辩，符合《中华人民共和国学位条例》有关规定，达到我校学位授予标准，授予医学硕士学位。
（6）药物化学（medical chemistry）
学科门类：医学，代码：100701
所属一级学科：药学，代码：1007
研究方向：1、中藏药活性成分研究及开发利用；2、天然产物结构修饰与改造。
培养目标：本专业培养德、智、体、美全面发展的,适应社会主义现代化建设需要和具有较强实践能力，能在药品生产、检验及研究开发领域从事专业工作的高层次、应用型专门人才。
专业要求：系统掌握本学科的理论知识及本学科的实验方法和技能；熟悉所从事研究方向的发展趋势；具有独立进行科学研究工作的能力；能应用一种外语较熟练地阅读与专业有关的文献资料，并能用外文撰写论文。
学习年限：一般为3年。
课程设置：有机波谱分析、天然药物化学、高等有机化学、药物合成反应、现代分离技术、药物色谱分析、现代仪器分析原理、医学统计学、药学文献检索、
药物研究新技术与新方法、分子生物学概论、现代药学讲座等。
毕业要求：总学分≥37学分。学位课程8门，学位课程成绩≥70分获得相应学分，其它课程成绩60分获得学分。其中专业选修课不少于8学分，教学实践或社会实践不少于3学分。在规定修业年限内修满规定学分，通过思想品德考核，学位论文答辩，符合《中华人民共和国学位条例》有关规定，达到我校学位授予标准，授予医学硕士学位。
（7）藏药学（tibetan medicine）
学科门类：医学，代码：1007z1
所属一级学科：药学，代码：1007
研究方向：1、藏药文献古籍研究；2、藏药功效成分及质量控制技术研究；3、珍稀藏药材人工种植技术研究。
培养目标：本专业培养德、智、体、美全面发展的,适应社会主义现代化建设需要和具有较强实践能力，能在藏药生产、检验及研究开发领域从事专业工作的高层次、应用型专门人才。
专业要求：系统掌握坚实的藏药学基础理论和系统的专门知识；掌握现代药物研究及开发生产的基本方法和技能；熟悉所从事研究方向的发展与趋向；具有进行科研及独立担负专门技术工作的能力；能应用藏汉语言及一种外语较熟练地阅读与专业有关的文献资料，并能用外文或藏文撰写论文。
学习年限：一般为3年。
课程设置：天然药物化学、药物色谱分析、现代仪器分析原理、藏医基础理论、药理学、藏药学、藏药生药学、藏药经典文献阅读与研究、藏药材人工种植技术、药学文献检索、医学统计学、专业英语或专业藏语、现代药学讲座等。
毕业要求：总学分≥38学分。学位课程8门，学位课程成绩≥70分获得相应学分，其它课程成绩60分获得学分。其中专业选修课不少于8学分，教学实践或社会实践不少于3学分。在规定修业年限内修满规定学分，通过思想品德考核，学位论文答辩，符合《中华人民共和国学位条例》有关规定，达到我校学位授予标准，授予医学硕士学位。
生源要求和选拔方式：面向全国招生，招收对象应热爱藏医药学事业，具备一定的藏语文读写能力,具备一定藏医药学专业基本知识的本科学生或符合硕士研究生招生条件的其他学生，或者具有从事藏医药工作实践经验、大专以上学历的医药工作者。
（8）药用植物资源学（resource of the medicinal plants）
学科门类：医学，代码：1007z2
所属一级学科：药学，代码：1007
研究方向：1、藏药文献古籍研究；2、藏药功效成分及质量控制技术研究；3、珍稀藏药材人工种植技术研究。
培养目标：本专业培养德、智、体、美全面发展的,适应社会主义现代化建设需要和具有较强实践能力，能在药用植物学、资源学及其相关学科的科研机构、高等院校、企业从事研发工作或在与植物学相关的企业从事管理工作的高层次、应用型专门人才。
专业要求：掌握现代药用植物资源学的理论知识、实验技能；了解相关专业的原理和知识；掌握资料查询、文献检索及应用现代化信息技术获取相关信息的基本方法；具有良好的调查研究和综合分析问题、解决问题的能力；具有一定实验设计、归纳、整理、分析实验结果、撰写论文以及参与学术交流的能力。
学习年限：一般为3年。
课程设置：药用植物学研究进展、高级植物生理学、天然产物化学、分子生物学、seminar、中医药学概论、药用植物资源保护、与繁育学、药用植物生态学、现代遗传学、高级细胞生物学、植物显微技术、植物生理生化综合实验、综合波谱解析、天然产物分离纯化技术、现代植物学讲座等。
毕业要求：总学分≥40学分。根据专业要求确定由公共必修课程、基础课程、专业课程组成学位课程8门，学位课程成绩≥70分获得相应学分，其它课程成绩≥60分获得学分。其中专业选修课不少于12学分，教学实践或社会实践不少于4学分。在规定修业年限内修满规定学分，通过思想品德考核，学位论文答辩，符合《中华人民共和国学位条例》有关规定，达到我校学位授予标准，授予理学硕士学位。
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